O setor de Fisioterapia está sob a responsabilidade de dois fisioterapeutas e dispõe de duas salas para avaliação, duas salas para atendimento, uma sala de integração sensorial totalmente equipada, uma piscina aquecida à energia solar. Dando atenção prioritária aos pacientes com paralisia cerebral, sindrômicos, crianças com atraso D.N.P.M (atraso desenvolvimento neuropsicomotor) e outros quadros associados à deficiência mental e autismo.
Pais e professores são considerados coadjuvantes do processo terapêutico, e portanto recebem do setor orientações e capacitações sempre que se fizer necessário.
A sala de integração sensorial totalmente equipada sobre responsabilidade do setor de fisioterapia, funciona baseada em programas centrados em cada paciente, cujo objetivo maior é a integração do indivíduo ao meio garantindo-lhe uma maior autonomia e independência.